Alors qu'une année s'est écoulée depuis l'intégration de Kuroko dans l'équipe de Teikô, les joueurs de la G.M. remportent pour la deuxième année consécutive l'Intercollèges. Mais après le départ de l'entraîneur, le bel esprit d'équipe qui régnait entre eux vole en éclat. En effet, après Aomine, c'est au tour de Murasakibara puis d'Akashi de voir leur talent exploser et de changer brusquement de comportement... Le récit des années Teikô touche à sa fin, dévoilant les directions différentes adoptées par chacun des cinq génies du basket...