Shotaro a pris la tête d'un nouveau bataillon, le Bansatsutai, et s'est vu confier une périlleuse mission : aller tuer Shinsaku Takasugi en plein coeur du domaine de Choshu. La situation se complique encore davantage lorsque ses compagnons et lui se retrouvent face à d'étranges guerriers entièrement dévoués à la cause de leur ennemi juré, Rugi...