Des individus métamorphosés s'en prennent à leurs congénères: les porteurs. Leurs morsures entraînent inéluctablement l'infection, puis la mort. Un jeune lycéen, Haruki Amamiya, parvient enfin au district sécurisé de Kawa-uchi. Malgré qu'il soit sécurisé, il est incapable de protéger ceux qu'il aime. Il décide alors d'intégrer la brigade des sapeurs de Kawa-uchi et prend part à la grande opération de refoulement des porteurs. La première partie du plan ne se déroule toutefois pas comme prévu, et la brigade doit dors et déjà improviser un plan d'urgence.