Ce livre est le troisième volume de la trilogie intitulée « La fosse aux Vents ».

Le capitaine Pierre Rolland est le commandant de l'Argonaute qui appareille de San Francisco. Le second, Fourment, a du débarquer suite à un accident survenu lors du voyage aller. À l'arrivée en France, le lieutenant Gicquel qui a fait fonction de second depuis l'accident, invite le capitaine Rolland au mariage de sa soeur.

Lors du mariage, Rolland rencontre Geneviève, la soeur de la mariée. C'est le coup de foudre. Il l'épouse avant d'embarquer à bord de l'Atalante, en partance du Havre pour San Francisco. Geneviève embarque avec lui.

Avec Atalante, Roger Vercel clôt sa série de romans consacrés aux cap-horniers et aux grands voiliers français dans les années précédant la première guerre mondiale.