Des monstres nés des conséquences de radiations atomiques tuent des civils dans le désert de l'Utah. Ces horreurs amènent le Professeur Bruttenholm tuteur de Hellboy et Anders, l'agent du B.P.R.D. possédé par les vampires, à mener une enquête. Tous les indices pointent vers une étrange structure de verre, qui serait à l'origine de ces étranges et terrifiants événements...